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diff --git a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile
index 263a1a415eba..7f0baeccf969 100644
--- a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile
+++ b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile
@@ -6,13 +6,12 @@
 #
 
 PORTNAME=	Bio-Phylo
-PORTVERSION=	0.16
-PORTREVISION=	2
+PORTVERSION=	0.18
 CATEGORIES=	biology perl5
 MASTER_SITES=	CPAN
 PKGNAMEPREFIX=	p5-
 
-MAINTAINER=	ports@FreeBSD.org
+MAINTAINER=	wen@FreeBSD.org
 COMMENT=	Phylogenetic analysis using perl
 
 BUILD_DEPENDS=	p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \
@@ -22,25 +21,18 @@ BUILD_DEPENDS=	p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \
 		p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG
 RUN_DEPENDS=	${BUILD_DEPENDS}
 
-MAN1=	dndtag.pl.1 \
-	droptip.pl.1 \
-	bremer.pl.1 \
-	age2bl.pl.1 \
-	dnd2svg.pl.1
 MAN3=	Bio::Phylo.3 \
-	Bio::ObjectCompat.3 \
-	Bio::Phylo::Adaptor.3 \
-	Bio::Phylo::ConfigData.3 \
+	Bio::Phylo::Annotation.3 \
+	Bio::Phylo::Dictionary.3 \
+	Bio::Phylo::Factory.3 \
+	Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \
+	Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \
 	Bio::Phylo::Forest.3 \
 	Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
 	Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
 	Bio::Phylo::Generator.3 \
 	Bio::Phylo::IO.3 \
 	Bio::Phylo::Listable.3 \
-	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum.3 \
-	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Matrix.3 \
-	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node.3 \
-	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree.3 \
 	Bio::Phylo::Manual.3 \
 	Bio::Phylo::Matrices.3 \
 	Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
@@ -55,11 +47,25 @@ MAN3=	Bio::Phylo.3 \
 	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
 	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
 	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
+	Bio::Phylo::Meta.3 \
+	Bio::Phylo::Meta::XMLLiteral.3 \
+	Bio::Phylo::Mediators::NodeMediator.3 \
 	Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
 	Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
+	Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \
 	Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
 	Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
 	Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
+	Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Client.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Tolweb.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Service.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Resource::Description.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Resource.3 \
+	Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Timetree.3 \
+	Bio::Phylo::Project.3 \
+	Bio::Phylo::Set.3 \
 	Bio::Phylo::Taxa.3 \
 	Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
 	Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
@@ -68,13 +74,22 @@ MAN3=	Bio::Phylo.3 \
 	Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \
 	Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \
 	Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \
+	Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3 \
 	Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \
 	Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
 	Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::Document::libxml.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::Document::twig.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::DocumentI.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::Element::libxml.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::Element::twig.3 \
+	Bio::Phylo::Util::DOM::ElementI.3 \
 	Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
 	Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
+	Bio::Phylo::Util::Logger.3 \
 	Bio::Phylo::Util::XMLWritable.3
 
-PERL_MODBUILD=	5.7.2+
+PERL_CONFIGURE=	yes
 
 .include <bsd.port.mk>