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| -rw-r--r-- | biology/p5-Bio-Phylo/Makefile | 19 |
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diff --git a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile index edd4ea96ac55..32e882e5d35e 100644 --- a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile +++ b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile @@ -6,7 +6,7 @@ # PORTNAME= Bio-Phylo -PORTVERSION= 0.07 +PORTVERSION= 0.12 CATEGORIES= biology perl5 MASTER_SITES= ${MASTER_SITE_PERL_CPAN} MASTER_SITE_SUBDIR= Bio @@ -18,12 +18,12 @@ COMMENT= Phylogenetic analysis using perl BUILD_DEPENDS= ${SITE_PERL}/${PERL_ARCH}/Math/Random.pm:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \ ${SITE_PERL}/SVG.pm:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG \ ${SITE_PERL}/Exception/Class.pm:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \ - ${SITE_PERL}/${PERL_ARCH}/Scalar/Util.pm:${PORTSDIR}/lang/p5-Scalar-List-Utils + ${SITE_PERL}/${PERL_ARCH}/Scalar/Util.pm:${PORTSDIR}/lang/p5-Scalar-List-Utils \ + ${SITE_PERL}/IO/String.pm:${PORTSDIR}/devel/p5-IO-String \ + ${SITE_PERL}/XML/Simple.pm:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-Simple RUN_DEPENDS= ${BUILD_DEPENDS} MAN3= Bio::Phylo.3 \ - Bio::Phylo::CONSTANT.3 \ - Bio::Phylo::Exceptions.3 \ Bio::Phylo::Forest.3 \ Bio::Phylo::Forest::Node.3 \ Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \ @@ -36,6 +36,8 @@ MAN3= Bio::Phylo.3 \ Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \ Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \ Bio::Phylo::Matrices::Sequence.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Fastnewick.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Fastnexus.3 \ Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \ Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \ Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \ @@ -43,9 +45,14 @@ MAN3= Bio::Phylo.3 \ Bio::Phylo::Taxa.3 \ Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \ Bio::Phylo::Treedrawer.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::SVG.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \ Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 + Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \ + Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \ + Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \ + Bio::Phylo::Util::IDPool.3 PERL_CONFIGURE= yes |